Análise do perfil farmacológico de moléculas bioativas contra o SARS-CoV-2 para tratamento da Covid-19

Abstract

Este artigo apresenta o estudo de acoplamento dos fármacos: Molnupiravir®, Remdesivir® e Paxlovid® (Nirmatrelvir® + Ritonavir®) por meio do docking na proteína Mpro da Sars-CoV-2, que atualmente é utilizado no tratamento do Covid-19. Considerando conceitos básicos de biologia estrutural, acoplamento molecular (docking) e análises de bioinformática e quimioinformática. Essa protease foi analisada por ser essencial para a replicação do vírus pelo corpo. Tais dados corroboram com outras pesquisas conduzidas pelo laboratório LBBC da UFABC. Os fármacos analisados são eficazes, porém seu preço é elevado, portanto compreender sua ação possibilita novas pesquisas para a modificações estruturais destes ligantes com eficácia similar e preço mais acessível. Observou-se que as principais características físico-químicas destes fármacos são: grupo aromático, grupo hidrofóbico, grupo aceitador de ligação de hidrogênio e grupos doadores de ligação de hidrogênio e pontos de sinergia entre os resíduos: MET 165 e GLU 166 simultaneamente e interações moleculares estabelecidas com os resíduos: HIS 41, GLN 189, CYS 145, MET 165 e GLU 166.

Abstract: This article presents a docking study of the drugs Molnupiravir®, Remdesivir® and Paxlovid® (Nirmatrelvir® + Ritonavir®) with the Sars-CoV-2 Mpro protein, which is currently used to treat Covid-19. They are considering basic concepts of structural biology, molecular docking bioinformatics, and chemoinformatics analysis. This protease was analyzed because the virus needs to replicate in the body. These data corroborate other research conducted by the LBBC laboratory at UFABC. The drugs analyzed are effective, but their price is high, so understanding their action enables new research into structural modifications of these ligands with similar efficacy and a more affordable price. It was observed that the main physicochemical characteristics of these drugs are: the aromatic group, hydrophobic group, hydrogen bond acceptor group, and hydrogen bond donor groups and synergy points between the residues: MET 165 and GLU 166 simultaneously and molecular interactions established with the residues: HIS 41, GLN 189, CYS 145, MET 165 and GLU 166.