Modelagem computacional de metalotioneína do tipo um e dois da Arabidopsis Taliana

Abstract

O seguinte estudo tem como intuito propor um modelo tridimensional da sequência de aminoácidos das metalotioneínas da Arabidopsis thaliana do tipo um e dois, além de discutir as mudanças em termos de dinâmica molecular relativo ao grau de liberdade, conformação das respectivas moléculas, diferenças na sequência, estrutura função, propriedades dinâmicas entre as MTs, com intuito de encontrar distinções entre os dois tipos de metolotioneínas analisadas, além de reforçar conformação local das estruturas finais obtidas durante a modelagem, separando a sequencia de aminoácidos descrito na metodologia em cinco a dez peptídeos levando em consideração a sequência Cys, x, Cys (onde X representa outro aminoácido). A realização da modelagem computacional das metationeínas foi realizada utilizando software Yasara, para assim obterem-se mais informações sobre como elas funcionam e quais aspectos implicam no seu enovelamento e na sua capacidade de interagir com metais.

The aim of the present study is to propose a three-dimensional model of the amino acid sequence of Arabidopsis thaliana metallothioneins type one and two, and to discuss changes in terms of molecular dynamics relative to degree of freedom, conformation of respective molecules, sequence differences, In order to find distinctions between the two types of methoethioneins analyzed, it is necessary to reinforce the local conformation of the final structures obtained during the modeling, separating the amino acid sequence described in the methodology in five and ten peptides taking into account the sequence Cys, x, Cys (where X represents another amino acid). The computational modeling of the metationeins was carried out using Yasara software, in order to obtain more information on how they work and what aspects implies in their folding and in their ability to interact with metals.